Organizacja urzędu skarbowego została określona regulaminem organizacyjnym urzędu na podstawie zarządzenia Ministra Finansów z dnia 5 lutego 2019 r. w sprawie organizacji Krajowej Informacji Skarbowej, izby administracji skarbowej, urzędu skarbowego, urzędu celno-skarbowego i Krajowej Szkoły Skarbowości oraz nadania im statutów (Dz.Urz. Min. Fin. Fun. i Pol. Reg. z 2020 r. poz.16 z późn. zm.).
Urzędem skarbowym kieruje naczelnik urzędu, który odpowiada przed dyrektorem izby administracji skarbowej za prawidłową i terminową realizację zadań wykonywanych przez urząd skarbowy. Naczelnik urzędu skarbowego wykonuje zadania przy pomocy zastępców naczelnika urzędu, kierowników działów i referatów, kierujących wieloosobowymi stanowiskami i pracowników zatrudnionych na jednoosobowych stanowiskach.
